在张冉进宫后的第六日，大明军机处正式成立，军机处有军机大臣五人，分别由廖焕之、邬思道、王樊、董大山、王东担任，另外还有三十余人入军机任职，这些人主要是作为军机处的普通人员，品级在七品至六品不等，将在各部和第一次科举后在京任职的人员中进行挑选。
对于五位军机大臣的人员确定，朱怡成是存了些心思的，从表面上来，文官三人，武将二人，但实际上邬思道属于朱怡成的夹带，而其余四人中，也就是廖焕之是真正的文臣，再者他本就是文官之首，入军机在议事会和商人的角度给他们出了些主意，同时又把本土对澳门的政策详细讲述了一下，最终得出一个结论，那就是想要保住澳门，保住他们这些人的未来，必须做出一个选择，或者说是一种取舍。
在费尔南多的劝说下，一个以费尔南多为核心的组织开始成立了，这个组织的目标不是别的，是为了结束和大明之间的战争，取得大明的原谅，同时利用这战争的契机让澳门成为一个由议事会和商人为主的自由贸易的城市，从而脱离葡萄牙王国的管辖。